跳动城乡网Hubrecht研究所(KNAW)的Alexander van Oudenaarden小组的研究人员已经开发出GateID，这是一种无需使用抗体或遗传报告基因即可从组织中纯化目标细胞类型的新方法。GateID允许研究人员分离出多种细胞类型，例如干细胞，以便对其进行详细研究。研究人员已在10月3日的科学杂志《Cell》上发表了他们的研究结果。
体内有许多不同的细胞类型和亚型可以执行不同的任务。例如，干细胞是稀有的细胞类型，对于器官的形成和维持至关重要。另外，肿瘤由不同的细胞类型组成，每种细胞对治疗的反应可能不同。总的来说，研究单个细胞类型和亚型对于更好地了解它们在健康和疾病中的特性和功能很重要。
迄今为止，基于存在于细胞外部的特定标记物来纯化属于特定目标细胞类型的单个细胞(例如干细胞)。为了进行纯化，研究人员使用了能够结合这些标记物或在基因上修饰了感兴趣的细胞的荧光抗体。在这两种情况下，都可以通过流式细胞仪检测并特异性纯化荧光细胞。这些方法虽然功能强大，但并非总是可用。例如，在人类中不可能进行基因修饰，并且抗体的可获得性并非始终可用。因此，由于缺乏纯化溶液，某些细胞类型仍然是研究人员无法获得的。
Hubrecht研究所的研究人员开发了一种新工具GateID，该工具可以纯粹根据细胞的天然特征(例如形状，大小和粒度)纯化细胞类型，可以通过流式细胞仪进行测量。这种新方法可以纯化选择的细胞类型，而不必诉诸基因改造生物或市售抗体。
来自单元内部和外部的GateID信息。首先，研究人员通过从所选器官或组织中收集单个细胞来生成数据集。对于每个单个细胞，都测量了细胞的天然特征(它们从外部的外观)和特定基因表达谱(它们在内部的外观)。然后，研究人员通过它们的基因表达谱来鉴定每个单个细胞的细胞类型。然后将自然特征耦合到所识别的细胞类型。接下来，GateID能够选择最佳的自然特征，以在许多后续实验中纯化所需的细胞类型。研究人员表明，GateID可以将几种细胞类型分离到高纯度。
净化血液和胰腺细胞类型
在他们的研究中，研究人员使用GateID从斑马鱼的免疫系统中纯化出四种细胞类型，包括血液干细胞和祖细胞，以及人胰腺中的α和β细胞。将来，研究人员将能够使用GateID来纯化和研究选择的任何细胞类型，从干细胞到肿瘤细胞。
